Iunie în este cea mai înnorată lună din an. În iunie, vremea în este, de obicei, fierbinte. În medie, temperatura înaltă zilnică în iunie este cu aproximativ 28 grade peste zero. În medie, Zamboanga are 29 zile ploioase în iunie. Ploile sunt, de obicei, din abundență. Iunie, februarie, martieși aprilie se consideră cea mai nefavorabilă perioadă pentru a vizita Zamboanga.