Im Juni ist das Wetter in Wabasha meist warm. Die durchschnittliche Tagestemperatur im Juni beträgt etwa 23 Grad über Null. Im Durchschnitt hat Wabasha im Juni 12 Regentage, 10 heitere Tage, 6 Tage mit wechselnder Bewölkung, und 2 trübe Tage. Es regnet normalerweise stark.