Im September ist das Wetter in Vytegra meist warm. Die durchschnittliche Tagestemperatur im September beträgt etwa 13 Grad über Null. Im Durchschnitt hat Vytegra im September 12 trübe Tage, 11 Regentage, 4 heitere Tage, und 3 Tage mit wechselnder Bewölkung. Es regnet normalerweise leicht.