През юни, времето в Šibenik обикновено е топъл,. Средната дневна висока температурапрез юни е около25 градуса над нула. Средно в Šibenik има 25 слънчеви, 3 дни с променлива облачност и 2 дъждовни дни през юни. Дъждовете са обикновено леки. юни се счита за най-подходящото време за посещение на Šibenik.