През юни, времето в Пограничный обикновено е топъл,. Средната дневна висока температурапрез юни е около22 градуса над нула. Средно в Пограничный има 17 дъждовни, 7 слънчеви, 4 дни с променлива облачност и 2 облачни дни през юни. Дъждовете са обикновено силни.