Im Juni ist das Wetter in Mustaqillik meist heiß. Die durchschnittliche Tagestemperatur im Juni beträgt etwa 32 Grad über Null. Im Durchschnitt hat Mustaqillik im Juni 21 heitere Tage, 7 Tage mit wechselnder Bewölkung, und 2 Regentage. Es regnet normalerweise stark.