Im September ist das Wetter in Kirksville meist warm. Die durchschnittliche Tagestemperatur im September beträgt etwa 23 Grad über Null. Im Durchschnitt hat Kirksville im September 19 heitere Tage, 6 Tage mit wechselnder Bewölkung, 4 Regentage, und 1 trüben Tag. Es regnet normalerweise stark. September sowie im August sind die günstigsten Monate, um Kirksville zu besuchen.