През септември, времето в Карнаухово обикновено е топъл,. Средната дневна висока температурапрез септември е около16 градуса над нула. Средно в Карнаухово има 9 дни с променлива облачност, 7 дъждовни, 7 слънчеви и 7 облачни дни през септември. Дъждовете са обикновено леки.