September di Iqaluit adalah bulan paling berawan dalam setahun. Pada September, cuaca Iqaluit biasanya dingin. Suhu tinggi harian rata-rata pada September adalah sekitar di atas nol. Rata-rata, Iqaluit memiliki , , , dan pada September. Hujan biasanya ringan. September, Februari, Maret, dan Desember dianggap waktu paling baik untuk mengunjungi Iqaluit.