Szeptember az időjárás Eniseysk általában meleg. Az átlagos napi maximális hőmérséklet Szeptember körülbelül +10 fok. Átlagosan Eniseysk14 esősés 8 felhősés 5 naposés 3 részben felhős nap van Szeptember. Az eső általában gyenge. A Szeptember, Február, Áprilisés Május általában a legkellemetlenebb idő Eniseysk meglátogatására.