През септември, времето в Афанасово обикновено е топъл,. Средната дневна висока температурапрез септември е около16 градуса над нула. Средно в Афанасово има 11 дни с променлива облачност, 8 облачни, 7 слънчеви и 4 дъждовни дни през септември. Дъждовете са обикновено леки.